Amblygobius buanensis kommt in sandigen innere Wattenzonen in der Nähe von Mangroven, in Seegraswiesen und in Innenriffen vor, in der Regel schewebt die Grundel ein Stück über dem Boden.
Die Grundel ernährt sich von kleinen wirbellosen Tieren und organische Stoffen wie Detritus.