Vom im selben Lebensraum vorkommenden zweifarbigen, vorne violett und hinten gelb gefärbten Königs-Feenbarsch (Gramma loreto) unterscheidet sich der Schwarzkappen-Feenbarsch vor allem durch seine fast den gesamten Körper umfassende, violette Grundfärbung. Lediglich auf der Kopfoberseite liegt eine schwarze Zone, die von der Schnauzenspitze über die Augen bis zur vorderen Hälfte der Rückenflosse reicht. Die Schwanzflosse ist beim Schwarzkappen-Feenbarsch mondsichelförmig mit spitzen oberen und unteren Loben. Die Bauchflossen sind wesentlich kürzer als beim Königs-Feenbarsch und reichen gerade bis zum Beginn der Afterflosse.